Temmuz 1969'da Neil Armstrong ve Buzz Aldrin'in iki buçuk saat süren ay macerası sırasında, antik ay yüzeyine Apollo 11 bayrağını dikmek sadece on dakika sürdü. Ancak, bu bayrak bilimi tarihindeki dönüm noktası olan olay, özellikle "ayın kime ait olduğu" konusundaki tartışmalar ve endişeler olmadan gerçekleşmedi (Bayrak bilimi, bayrakların tarihi, sembolizmi ve kullanımıyla ilgilenen bir çalışma alanıdır). İskoçya'daki Dundee Üniversitesi'nde tarih dalında kıdemli bir öğretim görevlisi olan Matthew Ward, Amerikan bayrağının benzersiz bir güce sahip olduğunu ve Apollo ay inişinden 2001'deki 11 Eylül saldırıları sırasında Dünya Ticaret Merkezi'nin kalıntılarına bayrak diken itfaiyecilere kadar her önemli Amerikan tarihî olayının görselinde bulunduğunu belirtiyor. Şöyle ekliyor: "Bu kadar anlam taşıyan başka bir bayrağı düşünmek zor. Amerikan bayrağı, bir ulusun ruhunu, tarihini ve kimliğini temsil ediyor."
1990'ların başında, o dönemde Houston, Teksas'ta Hernandez Engineering ile çalışan Ann Pelatov, bir NASA yüklenicisi için "Daha Önce Hiçbir Bayrağın Gitmediği Yer: Aya Bayrak Dikmenin Politik ve Teknik Boyutları" başlıklı bir rapor hazırladı. Pelatov, Apollo 11 bayrağının aya dikilmesinin tamamen sembolik olduğunu açıklıyor. Amerika Birleşik Devletleri, Birleşmiş Milletler Dış Uzay Anlaşmasına taraf olduğundan, aya herhangi bir toprak iddiasından feragat etti. Ancak, yerel ve uluslararası düzeyde bu olayın uygunluğu konusunda tartışmalar ortaya çıktı, Pelatov'un belirttiği gibi. ABD Kongresi, yalnızca Amerika Birleşik Devletleri tarafından finanse edilen görevlere ait olan ayda başka ülkelerin veya uluslararası derneklerin bayraklarının dikilmesini önlemek için NASA'nın ödenek yasasını değiştirdi. Pelatov'un raporu, ay yüzeyinde Amerikan bayrağının bulunmasının ayın yasal statüsünü kesinlikle etkilemeyeceğini belirtmektedir, "ancak NASA, bunun sonucunda ortaya çıkabilecek uluslararası tartışmanın farkındaydı."
Pelatov'un raporunda, NASA mühendislerinin Apollo bayrağını ayda dikme olasılığına karşı karşıya kaldığı zorluk not edildi. Pelatov şöyle açıklıyor: "Bayrağın rüzgâr olmadan dalgalanabilmesini sağlamak için yatay bir çubukla tasarlanmış bir bayrak direği tasarladılar, bu da ayın atmosfer eksikliğinin etkilerini dengelemek içindi. Diğer tasarım hususları arasında ağırlık, ısıya direnç ve astronotların hareket alanlarını ve kavrama yeteneklerini sınırlayan uzay giysileri nedeniyle kolay montaj yer alıyordu."
Apollo 11 astronotu Buzz Aldrin, ayda yürüyen ilk insanlardan biri olarak, "Life" dergisinde yayımlanan bir makalede, bayrağa baktığında tüm dünya insanları için "gizemli bir bütünleşme" hissettiğini anlattı. Aldrin, Armstrong ile birlikte yerel olarak Houston'dan 5.50 dolara satın alınan bayrağı diktiklerinde hissettiklerini de tarif etti. Aldrin şöyle ekledi: "Yumuşak yüzeyin altındaki toprak son derece yoğundu. Bayrak direğini yalnızca birkaç inç kadar itebildik. Çok sağlam görünmüyordu."
Pelatov'un araştırması, Apollo astronotları tarafından aya dikilen altı bayrağın farklı boyutlarda olduğunu buldu. Ayrıca, Aralık 1972'de, programın son ay görevinde dikilen Apollo 17 bayrağı benzersiz bir öneme sahipti; diğer Apollo misyonları sırasında Görev Operasyonları Kontrol Odasında sergilenmişti ve ardından ayda son ay yüzeyinde yürüyen ekip tarafından, Eugene Cernan ve Jack Schmitt, tarafından dikildi. Bu bayrakların mevcut durumu bilinmemektedir. Astronotlar ayı terk ederken bayraklar dimdik kaldıysa bile, muhtemelen ilk dikildiklerinden bu yana aynı durumda değiller. Pelatov'un tahminine göre, naylon bayrakların güneşe uzun süre maruz kalmaları sonucu bozulmuş olmaları, "güneş-epimi çürümesi" olarak bilinen yıkıcı bir sonuçtur. Ay bayrakları muhtemelen kırılgan hale geldi ve zamanla çürümüş olabilir. Pelatov, potansiyel meteor çarpmalarının da bayraklar için tehdit oluşturabileceğini belirtmektedir. Pelatov, şu anda Kaliforniya Üniversitesi, Santa Barbara'da kütüphaneci, tarihçi ve bayrak bilimcisi olarak çalışan Pelatov, şöyle diyor: "Makalelerde sürekli olarak bayrakların güneşe maruz kalma nedeniyle ağaracağını belirtiyorlar. Bu bazı bayraklar için Dünya'da gerçekleşirse, ay ortamında olup olmayacağına dair kimyasal süreci bilmiyorum."
Pelatov'un 2011 yılında yayımladığı "Ayda Altı Bayrak: Ay İnişi Komplo Teorilerinde Bayrakların Rolü" adlı yayında yazdığı gibi, ister bayraklar ayakta kalmış ister sert ay ortamında on yıllar boyunca varlıklarını sürdürmüş olsunlar, bunların "insan uzay keşifleri sembolü olarak mirasları devam etmektedir." Pelatov, bu görüntülerin "bu tarihî çabaya katılanlar geçip gittikten çok sonra bile" önemini sürdüreceğini ekliyor. Apollo ay inişi komplo teorisinin yanlış olduğunu destekleyenlere gelince, Pelatov bu konuda son derece kararlı. Space.com'a şöyle açıkladı: "Apollo ay inişi hakkındaki komplo teorilerini çürütmek zor değil. Apollo inişlerinin gerçek olduğunu ve insanların ay yüzeyine ayak bastığını kanıtlayan bol miktarda kanıt var." Pelatov, asıl sorunun eleştirel düşünmenin eksikliğinde yattığını ekliyor. Apollo programına katılan herkesin bu aldatmacayı elli beş yıl sürdürmek için işbirliğini sürdürmenin mümkün olduğuna gerçekten inanıyor musunuz? Yoksa bilim ve teknolojinin gücünü kullanarak astronotları aya indirme ve güvenli bir şekilde Dünyaya geri döndürme hedefine ulaşılması daha mı olasıydı? Pelatov, Apollo ay inişini inkâr edenler için "neye inanmak istiyorlarsa ona inanmakta özgürler, ama bu onların haklı olduğu anlamına gelmez" diyerek sözlerini noktalıyor.